كانت أولى الأسماء المذكورة من عام 794 للمدينة هي فراكونفورد (Frankonovurd) باللغة الألمانية القديمة العليا أو (Vadum Francorum) باللاتينية، وتغير الاسم إلى فراكينفوررت (Frankenfort) خلال العصور الوسطى ومن بعدها إلى فراكينفورت (Franckfort) و(Franckfurth) في العصر الحديث. وبحسب المؤرخ التشيكي ديفيد غانس تمت تسمية المدينة في حوالي عام 146 بعد الميلاد بواسطة بانيها وهو ملك إفرنجي يدعى باسم زونا، والذي حكم هذه المنطقة التي كانت تُعرف بمسمى سيكامبريون. وقد تمنى ان يتم تخليد اسم ذريته. حيث اشتق الاسم من كلمة (Franconofurd) وهي قبيلة جرمانية إفرنجية.

وبحلول القرن التاسع عشر، تم تأسيس الهجاء الرسمي للمدينة وهو Frankfurt ، ونادراً ما يرى الهجاء الإنجليزي القديم (Frankfort) للإشارة إلى فرانكفورت أم ماين، وبالرغم من ذلك العديد من المدن والبلدات خصوصاً في الولايات المتحدة الأمريكية تستخدم هذا الهجاء القديم، على سبيل المثال: فرانكفورت، كنتاكي (فرانكفورت (كنتاكي))، فرانكفورت، نيويورك (فرانكفورت (نيويورك))، فرانكفورت، إلينوي (فرانكفورت (إلينوي))

وقد تم استخدام اللاحقة «أم ماين» (am Main) بانتظام منذ القرن الرابع عشر، ويُترجم اسم المدينة الكامل للعربية بمعنى «فرانكفورت على الماين» وتقع فرانكفورت على مخاضة نهر الماين.

تُعرف المدينة ببساطة بإسمها فرانكفورت بين المتحدثين غير الألمان، ولكن الألمان يطلقون عليها اسمها الكامل للتفرقة بينها وبين المدينة الألمانية فرانكفورت أودر الواقعة بالولاية الفدرالية براندنبورغ، بين الحدود البولندية.

تستخدم الاختصارات فرانكفورت ماين، فرانكفورت (م)، فرانكفورت أيه. أم، أو فرانكفورت/أم في لوحات الطرق وخدمات السكك الحديدية، والاختصار الشائع للمدينة هو "FMM" ويستخدم أيضاً رمز إياتا "FRA" لمطار فرانكفورت.